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一时间明太仆寺少卿才发现情况不太对劲，他心想；难怪之前出市集的时候没有见到大批百姓？估计多半不是躲避疫情？就是逃走了？或者是猝死在府宅中！
想到这明太仆寺少卿有些害怕了，他连忙出了轿子跑回府中，跑到府门口时还让家丁去把京城最好的大夫给请来以便医治，家丁有些害怕不敢前去，明太仆寺少卿就给出十两银子作为跑路费，这才让家丁冒着生命危险前去街道上找大夫。
家丁再次上街之时看到除了几处主要的大道还有百姓居住外，其余府宅要么大门敞开、要么无人居住！偶尔看到有几个人行走之外，其余的小街小巷都是关闭家门的，而且家家户户门口都高挂着白色的灯笼，门前还张贴着许多去邪避凶的符咒，看上去很是阴深！
吓得家丁大步奔跑着，在来到一处医馆门前时他还看到有七八个躺在地上，脸色发青眼角出血的百姓，奄奄一息地咳嗽道“救、救救我！给我汤药吧！”
见此情景家丁咽了一口气，壮起胆子走进去医馆里面，喊道“大夫、大夫在吗？”
在接连喊了三四声后就见到一个白发苍苍的老者，拿着一碗汤药走了出来，但是这位年老的大夫脸色似乎不太对劲？家丁仔细一看发现大夫的眼角隐约流出了黑色的血，嘴巴也是紫色的看上去极其恐怕。
胆小如鼠的家丁连忙退了几步转身朝门外跑去，还说道“我不想死、我还不想死！我要离开这里、离开……。”
此时帝都的三座城内，守军们也开始有士兵出现了呕吐、发冷、发热、浑身疼痛等症状，先后波及到了京畿地区的；五城兵马司（东南西北中。）、京军三大营、南北镇抚司、亲军京卫指挥使司、十二监（司礼监、内官监、御用监、司设监、御马监、神宫监、尚膳监、尚宝监、印绶监、直殿监、尚衣监、都知监。）、上林苑监、六部（兵工礼吏刑。）、六科（兵工礼吏刑。）、五大寺（大理寺、太常寺、光禄寺、太仆寺、鸿胪寺。）、都察院、詹事府、宗人府、钦天监、国子监、行人司、通政司、武学、僧录司、道录司、教坊司以及后宫内廷部分宫殿区域。
发生这次突如其来的大规模病情时，太医院与南北镇抚司锦衣卫们率先出动人员控制情况，明锦衣卫左都督还手持令牌带领手下的锦衣卫队们分散开来，在宫中各个角落开始检查人员发病情况，一旦发现有病情者立刻送往太医院治疗。
在逐一调查各机构部门情况之时，发现大多数人（主要是与京师外面接触过的人员，多为正四品左右的官员？）
而太医院方面当天接到的病人数量多达三千人，部都是统一的病症！均为风寒之症？这让太医院的医官们感觉很是奇怪，资历高深的明太医院院使：关之庆，在带着面巾号了几次脉搏之后就得出了一个结论？
凭他多年的行医经验分析出这些病者，应该得的是一种来自于鼠疫的病情？在综合得病多数的病者来看，这疫情应该是由京城外界传播进来宫中的？
于是明太医院院使在号完脉之后，就转身让太医院内戴着面巾的下人带病者去外面晒太阳，自己则对身边的医官大夫们说道“此症状乃是百年不遇的鼠疫！自万历八年至今宫中还从未见过此病症，老夫不才曾在医书中见过鼠疫的症状与他们情况，并无太太区别！”
（其实早在崇祯十年辽东都司地区的小冰期与中原地区的河床干枯以及蝗虫灾荒，就先后在山西承宣布政司、山东承宣布政司、陕西承宣布政司、北直隶、南直隶、河南承宣布政司、浙江承宣布政司等地爆发了鼠疫、天花、疟疾三种病症了！）
只是京城地区平常没什么官员接触地方百姓，毕竟京城官员居住区与百姓居住区是分开隔离的，基本上接触不到！除了市集口。
但一般的普通百姓都不可能去，因为去的百姓多数是有钱人，都是去买东西的，平常穷苦人家百姓根本没有那个资本，而疫情又是经过村庄地区的百姓传播出去的，所以也就很少有人能够了解到疫情是怎么回事了！
这下被明太医院院使诊断出来，可吓坏了在场的所有医官大夫们，为了不把消息泄露出去造成城混乱，故此明太医院院使就下令把此事封锁起来，只是对外宣称病人们得了（疟疾），又为了不让病情扩大化，还让城军民们佩戴起了面巾，并在宫中各处要道采取了隔离措施减少伤亡。